Syberia ogłosiła niepodległość po wojnie z Rosją i Mongolią. Nergui Kurczatow, premier Syberii, jest sceptyczny co do nadziei ludzi na sprawiedliwy podział bogactwa i wkrótce staje się autokratycznym władcą. W obliczu korupcji i nadużywania władzy przez nowy rząd, powstaje zbrojna opozycja, zwana Wilkami Syberyjskimi.
Snajper o kryptonimie „Seeker” zostaje wysłany na serię niebezpiecznych misji przez tajemniczego sponsora, który ma za zadanie stopniowo eliminować członków elity Syberii: generała Dimitrija Ivanovskiego, dyrektora generalnego firmy naftowej Igora Sekhova i jego żonę Olgę Kurchatovą (siostrę Nergui Kurchatova). W skład misji wchodzi również duet przestępczych bossów: Sasha Petroshenko z klanu Yakutz i Agvan Dorgev z West Siberian Syndicate, a także naukowiec starający się genetycznie modyfikować ludność Syberii, Anatashia Elikanova i jej ojciec, Zelik Elikanov, a na koniec sam Nergui Kurchatov jako ostatni kontrakt.